Planejamento Tributário

ISSQN Cotia: boleto, vencimento, autônomo e profissional liberal, e o que muda quando vira empresa

Arquiteto autônomo em Cotia emitindo pelo site da Prefeitura o boleto anual do ISSQN e da taxa de licença

DOSSIÊ TÉCNICO ESTRATÉGICO 2026
Foco Regional: Cotia, Granja Viana, Osasco e região
Tempo de leitura: 9 min.  |  Categoria: Planejamento Tributário

Resposta Direta

Em Cotia, o autônomo e o profissional liberal inscritos na Prefeitura pagam o ISSQN por valor fixo, lançado uma vez por ano. É a lógica do art. 9º, § 1º, do Decreto-Lei 406/1968: trabalho pessoal do próprio contribuinte não paga percentual sobre o preço. O calendário sai em decreto a cada exercício. Em 2025 o Decreto Municipal 9.415/2025 fixou a parcela única e a primeira parcela em 31 de outubro. O ISSQN de Profissionais Liberais teve até duas parcelas, a segunda em 28 de novembro. O ISSQN de Autônomos teve até quatro (14 de novembro, 28 de novembro e 15 de dezembro). A Taxa de Licença de Funcionamento, devida por quem tem estabelecimento, segue as mesmas datas. O boleto passou a ser emitido só pelo site da Prefeitura. Quem abre empresa sai do lançamento anual e passa a pagar ISS pela nota, na alíquota do Anexo Único da LC 55/2003. É 2% em quase todo serviço intelectual e 3% na execução de obra. No Simples Nacional o ISS vai dentro do DAS (LC 123, art. 13, VIII).

Premissas: Base conferida em setembro de 2026 nas páginas oficiais da Prefeitura de Cotia: vencimentos de 2025 e Decreto 9.415/2025, serviços online da Fazenda e alerta sobre cobranças falsas. Também nos textos oficiais do Decreto-Lei 406, da LC 116 e da LC 123. A base do valor fixo é o art. 11, §§ 1º a 3º, da LC 55/2003, lida no texto compilado do portal de legislação. Os valores em reais do Anexo Único são de 2003 e são atualizados por decreto, então não aparecem. O calendário de 2026 sai em decreto próprio.

Como o ISSQN do autônomo é cobrado em Cotia

A regra geral do ISS é percentual sobre o preço do serviço, no município do estabelecimento prestador (LC 116, art. 3º). A exceção que interessa aqui vem do Decreto-Lei 406/1968, cujo art. 9º, § 1º, continua em vigor. Quando o serviço é prestado sob a forma de trabalho pessoal do próprio contribuinte, o imposto não olha o preço. É calculado por alíquota fixa ou variável em função da natureza do serviço. É a base do ISSQN de autônomo e de profissional liberal que Cotia lança todo ano. O § 3º do mesmo artigo estende a lógica às sociedades de profissionais, que pagam por profissional habilitado.

Em Cotia o lançamento é anual e separado em dois cadastros, ISSQN Profissionais Liberais e ISSQN Autônomos, cada um com o próprio parcelamento. A inscrição do autônomo é pedida em formulário próprio da Fazenda, distinto do VRE usado pelas empresas. A Prefeitura lança o imposto pela inscrição ativa: quem parou de trabalhar e não pediu baixa continua recebendo lançamento.

Em Cotia a regra está no art. 11, § 1º, da LC 55/2003. O trabalho pessoal do próprio contribuinte paga valor fixo anual, pela natureza do serviço. O § 2º estende isso à sociedade uniprofissional de engenharia, arquitetura, advocacia, contabilidade e outras profissões listadas, por profissional habilitado. O § 3º, na redação da LC 320/2021, tira do regime a sociedade com sócio pessoa jurídica ou sócio só de capital. Também a que tem mais de uma atividade ou caráter empresarial. Os valores em reais do Anexo Único são de 2003 e são atualizados por decreto; o lançamento do próprio contribuinte é a conferência.

Fonte oficial: Decreto-Lei nº 406/1968, art. 9º, § 1º: quando se tratar de prestação de serviços sob a forma de trabalho pessoal do próprio contribuinte, o imposto será calculado, por meio de alíquotas fixas ou variáveis, em função da natureza do serviço ou de outros fatores pertinentes, nestes não compreendida a importância paga a título de remuneração do próprio trabalho.

Calendário, parcelas e o boleto que só sai pelo site

As datas mudam por decreto a cada exercício. Em 2025 valeu o Decreto Municipal 9.415/2025, com parcela única e primeira parcela em 31 de outubro. Vale para os quatro tributos do lote: Taxa de Licença de Funcionamento, Taxa de Licença para Feirantes, ISSQN Profissionais Liberais e ISSQN Autônomos. A Licença de Funcionamento e o ISSQN de Profissionais Liberais tiveram segunda parcela em 28 de novembro. O ISSQN de Autônomos e a taxa de feirantes tiveram quatro parcelas. As demais caíram em 14 de novembro, 28 de novembro e 15 de dezembro. A partir daquele ano a emissão do boleto ficou exclusivamente pelo site: Portal de Serviços, Taxas e Tributos, segunda via de ISSQN, taxas e multas.

Dois cuidados que a própria Fazenda publicou. Em dezembro de 2024 ela alertou que circulavam e-mails falsos com cobrança da Taxa de Licença de Funcionamento em nome da Prefeitura. Toda comunicação oficial vem de endereço terminado em @cotia.sp.gov.br. Pendência de verdade se confere no Portal de Serviços com login e senha, ou no CIT. Segunda via, parcelamento e baixa de débito já inscrito vão por dividaativa@cotia.sp.gov.br. Alteração e baixa de inscrição vão por tributacao@cotia.sp.gov.br.

Tributo (2025)Parcela única e 1ªDemais parcelas
Taxa de Licença de Funcionamento31/10/20252ª em 28/11/2025
ISSQN Profissionais Liberais31/10/20252ª em 28/11/2025
ISSQN Autônomos31/10/202514/11, 28/11 e 15/12/2025
Taxa de Licença para Feirantes31/10/202514/11, 28/11 e 15/12/2025

Fonte oficial: Prefeitura de Cotia, 24/10/2025: os contribuintes do ISSQN e das Licenças de Funcionamento e de Feirantes devem ficar atentos com a data de vencimento da primeira parcela e da parcela única dos tributos, 31 de outubro de 2025. Neste ano, a emissão dos boletos de pagamento dos tributos será exclusivamente pelo site da Prefeitura. As datas de pagamento dos tributos constam no Decreto Municipal 9.415/2025.

Taxa de Licença de Funcionamento: quem paga e como sair dela

A Taxa de Licença de Funcionamento é a taxa de poder de polícia sobre o estabelecimento. Quem tem sala, loja, escritório ou oficina em Cotia recebe o lançamento todo ano, no mesmo calendário do ISSQN fixo. Ela não depende de a atividade ter faturado; depende da inscrição estar ativa. É por isso que empresa parada, autônomo que virou CLT e escritório que mudou para outra cidade continuam recebendo boleto. Isso só para com a baixa ou a alteração cadastral, pedidas por tributacao@cotia.sp.gov.br.

Quem trabalha de casa ou de forma remota precisa conferir, na inscrição, como o endereço foi cadastrado, porque é o cadastro que gera o lançamento. É uma das razões para o cadastro fiscal em Cotia ser revisado uma vez por ano. Antes de o decreto de vencimentos sair, não depois de o boleto chegar.

Quando a pessoa jurídica passa a compensar

O autônomo com ISSQN fixo tem o ISS mais barato que existe. Ainda assim costuma pagar mais imposto no total do que a pessoa jurídica no Simples. O motivo está fora da Prefeitura. Sobre o rendimento do autônomo incide o imposto de renda pela tabela progressiva, pelo carnê-leão, mais o INSS de contribuinte individual. No Simples Nacional o conjunto de tributos federais e municipais é uma alíquota só, pelos anexos da LC 123. O ISS entra dentro do DAS (art. 13, VIII), sem lançamento anual da Prefeitura. Para desenvolvedor, arquiteto, engenheiro ou corretor que fatura para empresa, é essa comparação que decide, e não a alíquota municipal. A conta está em qual regime tributário para prestador de serviços.

Ao abrir a empresa, três coisas mudam em Cotia. O ISS deixa de ser lançado por ano e passa a ser calculado por nota, na alíquota do Anexo Único da LC 55/2003. É 2% em quase todo serviço intelectual e 3% na execução de obra. No Simples, essa alíquota só aparece na retenção pelo tomador, feita pela alíquota do anexo (LC 123, art. 21, § 4º). No Presumido ou no Real ela pesa todo mês. A nota passa a sair pela Nota Fiscal Cotiana, com código de serviço escolhido no cadastro. E a inscrição de autônomo precisa ser baixada, senão o lançamento anual continua vindo junto com a empresa nova.

Essa simulação, com o faturamento real, o pró-labore e a folha, é o planejamento tributário que fazemos antes de qualquer abertura. O passo a passo da abertura está em como abrir empresa em Cotia. A retenção que o tomador faz na nota está em retenção de impostos na nota de serviço.

SituaçãoISS em CotiaImposto de renda
Autônomo ou profissional liberal inscritoValor fixo, lançado por ano (DL 406, art. 9º, § 1º)Carnê-leão pela tabela progressiva
Empresa no Simples NacionalDentro do DAS pela parcela do anexo (LC 123, art. 13, VIII)Alíquota única do anexo
Empresa no Lucro PresumidoAlíquota do subitem sobre cada notaIRPJ e CSLL sobre a presunção
Sociedade de profissionaisValor fixo por profissional (DL 406, art. 9º, § 3º), se o município admitirConforme o regime

Perguntas frequentes sobre o ISSQN de autônomo em Cotia

Como o autônomo paga ISSQN em Cotia?

Por valor fixo, lançado uma vez por ano pela Prefeitura, em vez de percentual sobre o que fatura. A base é o art. 9º, § 1º, do Decreto-Lei 406/1968. Ele manda calcular o imposto do trabalho pessoal do próprio contribuinte por alíquota fixa ou variável conforme a natureza do serviço, sem considerar o preço. Cotia mantém dois cadastros, ISSQN Profissionais Liberais e ISSQN Autônomos, cada um com o próprio parcelamento fixado por decreto a cada exercício. Em 2025 o Decreto Municipal 9.415/2025 marcou a parcela única e a primeira parcela em 31 de outubro. O ISSQN de Profissionais Liberais teve segunda parcela em 28 de novembro. O ISSQN de Autônomos teve quatro parcelas, com as demais em 14 de novembro, 28 de novembro e 15 de dezembro. O boleto é emitido só pelo site da Prefeitura, no Portal de Serviços, em Taxas e Tributos, segunda via de ISSQN, taxas e multas. A inscrição de autônomo é pedida em formulário próprio da Fazenda. O lançamento acompanha a inscrição ativa: quem parou precisa pedir baixa por tributacao@cotia.sp.gov.br. A regra do valor fixo é o art. 11, § 1º, da LC 55/2003. Os valores em reais do Anexo Único são de 2003, atualizados por decreto, e por isso não estão reproduzidos aqui.

Qual a diferença entre ISSQN de profissional liberal e de autônomo em Cotia?

No calendário e no cadastro. A Prefeitura de Cotia lança os dois como tributos distintos, ISSQN Profissionais Liberais e ISSQN Autônomos. Em 2025 deu parcelamentos diferentes. O de profissionais liberais saiu em até duas parcelas, com a segunda em 28 de novembro. O de autônomos, em até quatro, com as demais em 14 de novembro, 28 de novembro e 15 de dezembro. Os dois tiveram parcela única e primeira parcela em 31 de outubro, pelo Decreto 9.415/2025. Os dois seguem a mesma base legal, o art. 9º, § 1º, do Decreto-Lei 406/1968, que trata do trabalho pessoal do próprio contribuinte. E os dois são cobrados pela inscrição, não pelo faturamento. Profissional liberal é, em regra, quem tem formação de nível superior e registro em conselho, como engenheiro, arquiteto, advogado e contador. Autônomo é quem trabalha por conta própria sem essa qualificação, como jardineiro, pintor e prestador de manutenção. Os valores em reais constam do Anexo Único da LC 55/2003, em números de 2003 atualizados por decreto; por isso não estão aqui. Na dúvida sobre o enquadramento, a resposta está no próprio lançamento e no cadastro, consultáveis no Portal de Serviços com login.

Quem tem escritório em casa em Cotia paga Taxa de Licença de Funcionamento?

Depende de como a inscrição foi cadastrada. A taxa é lançada pela inscrição ativa e pelo estabelecimento declarado, não pelo faturamento. A Taxa de Licença de Funcionamento é a taxa de poder de polícia sobre o local onde a atividade acontece. Quem declara endereço de funcionamento em Cotia recebe o lançamento todo ano, no mesmo calendário do ISSQN fixo. Em 2025 isso significou parcela única em 31 de outubro e segunda parcela em 28 de novembro, pelo Decreto 9.415/2025. Quem trabalha de forma remota e usa o endereço só para correspondência precisa conferir no cadastro como a atividade foi declarada. Se estiver errado, o ajuste é pedido por tributacao@cotia.sp.gov.br, porque cadastro errado gera boleto errado ano após ano. A Fazenda de Cotia também alertou, em dezembro de 2024, que cobrança da taxa só chega por e-mail terminado em @cotia.sp.gov.br. Pendência de verdade se confere no Portal de Serviços com login; boleto vindo de outro domínio é golpe. Quem encerrou a atividade pede baixa. Sem baixa, a taxa continua.

Vale a pena sair de autônomo e abrir empresa em Cotia?

Para quem fatura para empresas, na maior parte dos casos sim, e o ISS é a menor parte da resposta. O autônomo com ISSQN fixo paga pouco à Prefeitura. Em compensação paga imposto de renda pela tabela progressiva no carnê-leão e INSS de contribuinte individual sobre o rendimento. A pessoa jurídica no Simples Nacional paga uma alíquota só pelos anexos da LC 123, com o ISS dentro do DAS (art. 13, VIII). Para serviços intelectuais a chave é o Fator R, que decide entre o Anexo III e o Anexo V. Em Cotia a mudança tem três efeitos. O ISS deixa de ser lançado por ano e passa a ser calculado por nota, na alíquota do Anexo Único da LC 55/2003. É 2% em quase todo serviço intelectual e 3% na obra. No Simples ela só aparece na retenção pelo tomador. A nota passa a sair pela Nota Fiscal Cotiana. E a inscrição de autônomo precisa ser baixada, senão o lançamento anual continua. A decisão pede simulação com o faturamento real, o pró-labore e a folha. Abaixo de certo rendimento o autônomo ainda pode compensar; acima dele a empresa ganha com folga.

Resumo Estratégico

Cotia lança o ISSQN de autônomo e de profissional liberal por valor fixo anual (DL 406, art. 9º, § 1º; LC 55/2003, art. 11, § 1º). São dois cadastros com parcelamentos próprios fixados por decreto. Em 2025, o Decreto 9.415/2025 pôs a parcela única em 31/10 e o boleto só pelo site. A Taxa de Licença de Funcionamento segue o mesmo calendário e é lançada pela inscrição ativa, então baixa e alteração por tributacao@cotia.sp.gov.br evitam boleto indevido. Cobrança só por e-mail @cotia.sp.gov.br. Ao abrir empresa, o ISS passa para a nota, na alíquota do Anexo Único da LC 55/2003 (2% no serviço intelectual, 3% na obra), dentro do DAS no Simples (LC 123, art. 13, VIII). A comparação que decide é carnê-leão contra Simples, não a alíquota municipal.

Riscos com o ISSQN fixo em Cotia

  • Inscrição de autônomo sem baixa depois de abrir a empresa: lançamento anual continua, junto com o ISS da empresa. Solução Gestão Inova: baixa pedida por tributacao@cotia.sp.gov.br na abertura.
  • Boleto de taxa recebido por e-mail de fora: golpe com o nome da Prefeitura. Solução Gestão Inova: só e-mail @cotia.sp.gov.br; pendência conferida no Portal de Serviços.
  • Perder a parcela única: juros e multa sobre lançamento anual, com inscrição em dívida ativa. Solução Gestão Inova: decreto de vencimentos na agenda do escritório todo ano.
  • Continuar autônomo por causa do ISS baixo: carnê-leão e INSS comendo o que o ISS fixo economiza. Solução Gestão Inova: simulação autônomo contra Simples com o faturamento real.

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Referências Técnicas e Legais

[1] Prefeitura de Cotia, contribuintes do ISSQN e Licenças de Funcionamento devem ficar atentos ao vencimento (24/10/2025; Decreto Municipal 9.415/2025). https://cotia.sp.gov.br/contribuintes-do-issqn-e-licencas-de-funcionamento-devem-ficar-atentos-ao-vencimento/

[2] Prefeitura de Cotia, Secretaria da Fazenda orienta o cidadão a utilizar serviços online (formulário de inscrição de autônomo; e-mails da tributação e da dívida ativa). https://cotia.sp.gov.br/secretaria-da-fazenda-orienta-o-cidadao-a-utilizar-servicos-online-para-evitar-a-ida-ao-centro-integrado-tributario/

[3] Prefeitura de Cotia, Fazenda alerta sobre mensagens falsas sobre pendências em taxas de funcionamento (13/12/2024). https://cotia.sp.gov.br/fazenda-alerta-sobre-mensagens-falsas-sobre-pendencias-em-taxas-de-funcionamento/

[4] Prefeitura de Cotia, Secretaria Municipal da Fazenda: CIT e polos. https://cotia.sp.gov.br/fazenda-e-planejamento-2025/

[5] Cotia, Lei Complementar nº 55/2003 (ISS), texto compilado: art. 11, §§ 1º a 3º (valor fixo de autônomo e sociedade uniprofissional), art. 6º (retenção) e art. 14 (vencimento). https://legislacaodigital.com.br/Cotia-SP/LeisComplementares/55-2003

[6] Brasil, Decreto-Lei nº 406/1968, art. 9º, §§ 1º e 3º. https://www.planalto.gov.br/ccivil_03/decreto-lei/del0406.htm

[7] Brasil, Lei Complementar nº 116/2003, arts. 3º e 8º-A; Lei Complementar nº 123/2006, art. 13, VIII, e art. 21, § 4º. https://www.planalto.gov.br/ccivil_03/leis/lcp/lcp116.htm

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Willian Ferreira da Silva

Willian Ferreira da Silva

Contador • CRC SP 1SP 287452/O-9

Especialista em gestão empresarial para pequenas e médias empresas, contabilidade, planejamento tributário, terceirização do financeiro e departamento pessoal.

Conteúdo revisado em 17/09/2026 conforme legislação vigente na data da publicação.

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